外阴大腺囊肿其实指的是前庭大腺囊肿，主要是由于病原体侵入前庭大腺所导致的。

病原体多为混合性细菌感染，包括葡萄球菌、大肠埃希菌、链球菌、肠球菌。随着性传播疾病的发展，淋病奈瑟菌及沙眼衣原体也成为了常见的致病菌。病原体可侵犯腺管，最开始导致前庭大腺的导管炎症，腺管开口可能因为肿胀或者渗出物凝聚而阻塞，分泌物引流受阻，感染进一步加重，就会形成前庭大腺脓肿。若脓肿消退后，腺管阻塞，脓液吸收后被粘液分泌物替代，就会形成前庭大腺的囊肿。前庭大腺囊肿可继发感染，形成脓肿，并且反复的发作。