慢性疲劳综合症需要综合性的治疗。

对于有头痛，肌肉酸痛的患者，可以选择服用镇痛的药物缓解，比如说对乙酰氨基酚，布洛芬，双氯芬酸钠等。对于有抑郁情绪患者，可以适当的服用一些调节神经的药物，包括复合B族维生素，谷维素等。比较严重的情况下，可以适当的服用抗抑郁的药物。如西太普兰，度洛西丁等等。另外，睡眠欠佳的患者，除了调节植物神经功能的药物以外，严重影响到正常生活的时候，适当的可以短期内服用安定等促进睡眠的药物。除此之外，患者还需要通过适当的休息，减少精神和身体上的压力来缓解。