胎停后查免疫主要是查免疫功能异常包括自身免疫功能异常和同种免疫功能异常，前者主要发生在抗磷脂抗体，抗b2糖蛋白，抗体狼疮抗凝血因子阳性的患者临床上可表现为胎停甚至复发性流产，也可同时存在有风湿免疫性疾病如系统性红斑狼疮等少数发生在抗核抗体阳性，抗甲状腺抗体阳性的孕妇。

后者是基于妊娠属于同种异体移植理论，母胎免疫耐受是胎儿在母体内得以生存的基础母胎免疫耐受有赖于孕妇在妊娠期间能够产生足够的针对父系人白细胞抗原的封闭因子，如夫妇的h LA相容性过大可以造成封闭性因子缺乏或自然杀伤细胞的数量和活性异常升高。