首先需要搞清楚是什么原因导致的孩子肠胃功能不好，再针对病因进行治疗。

有的孩子是跟感染相关，如果是病毒感染引起的，需要使用抗病毒的药物，可以给孩子配合调理肠胃的药物，促进胃肠功能的修复，也可以选择益生菌，改善肠道菌群，恢复孩子正常的菌群结构，调节孩子的免疫。

如果孩子存在细菌感染的需要，选择敏感的抗生素抗感染，可以配合调理肠胃的药物，也可以给孩子进行推拿治疗，如果孩子是因为过敏导致的过敏性结肠炎，寻找过敏的诱因并去除诱因，可以给孩子使用抗过敏的药物，同时配合益生菌。