咽喉部两侧有肉疙瘩的原因很多，比较常见的就是淋巴滤泡增生引起的，也有可能是由于扁桃体肥大导致的，有部分患者是由于咽部囊肿、咽部乳头状瘤引起的。

具体的发病原因和病情的严重程度有个体差异，发病以后，建议到耳鼻喉科就诊，可以做血常规检测，喉镜检查，这样就有助于判断具体病情，明确病情以后，可以进行针对性的治疗。

大部分患者可以选择药物保守治疗，但是也有一部分患者保守治疗效果不好，就需要做手术切除，手术以后还需要做病理切片化验，明确病理性质。