如果长期存在乳糖不耐受，危害性还是很大的，会影响孩子各种微量元素的摄入，导致孩子各种矿物质的缺乏，也会影响孩子钙的吸收，甚至市导致孩子营养素摄入不足，影响孩子的生长发育，甚至是体格发育，也会影响孩子的智力发育，造成孩子营养不良。

甚至是因为反复长时间的腹泻，刺激孩子肛周皮肤，导致孩子高烧皮肤的破溃、发炎，甚至会引起肛周脓肿，所以需要查找病因，给予治疗。