卵巢巧克囊肿，并非一定要切除卵巢，根据不同的年龄及是否有生育要求，手术的范围也不相同。

卵巢巧克力囊肿的治疗方法包括药物治疗和手术治疗。药物治疗的目的主要是抑制卵巢功能，阻止内异症的发展，对于较大的卵巢巧克力囊肿，建议采用手术治疗。手术治疗可以切除病灶，恢复解剖，适用于药物治疗后症状不缓解、局部病变加剧或生育功能未恢复者、较大的卵巢巧克力囊肿者。对于年轻有生育要求的患者，行手术治疗时，应保留一侧或双侧卵巢，至少保留部分卵巢组织。