引起早上一睡醒就肚子疼的原因有很多，比如可能是由于肚子受凉、夜间腹部保暖措施未做好，胃肠道受凉后肠道蠕动加快，胃肠道平滑肌痉挛，导致早上出现肚子疼的现象。

其次，也有可能是由于第一天晚上进食量太少，导致患者空腹的时间过长，胃酸侵蚀胃壁，造成患者的肚子疼痛，进食后即可缓解。

如果经常性的早上起床后肚子疼，也可能考虑是由于慢性的肠炎所导致。慢性肠炎的常见症状就是肚子疼，且反复发作，同时，可能伴随有消化不良以及腹泻的症状。

另外，急性胰腺炎阑尾炎、肠梗阻等疾病也会诱发肚子疼。