首先需要搞清楚是什么原因引起的肠胃不好，在针对病因进行治疗。

有的孩子是跟感染相关，因为各种病原菌的感染引起孩子胃肠功能的紊乱。明确病原菌，针对病原菌给予相应的抗感染治疗。病毒感染使用抗病毒的药物。如果是细菌感染的，需要选择敏感的抗生素抗感染。支原体感染的选择，大环内酯类的药物，真菌感染的使用抗真菌的药物。可以配合调理肠胃的药物。同时要注意孩子的饮食。母乳喂养的孩子母亲需要吃好消化的食物，有的孩子跟过敏相关，寻找过敏的诱因，祛除诱因，可以加用抗过敏的药物。