疱疹性咽峡炎经过粪、口途径传播，呼吸道飞沫、接触患儿口鼻分泌物以及被污染的手和物品而感染。

疱疹性咽峡炎发病率高，四季散发，春夏季是流行季节。主要侵犯五岁以下儿童，为自限性疾病。一般病程七天自愈。疱疹性咽峡炎一般有柯萨奇病毒感染多见，以急性发热和咽峡部疱疹溃疡为特征的急性感染性疾病。疱疹性咽峡炎与手足口病都属于肠道病毒感染。疱疹性咽峡炎与手足口病一般按同一种方法防治。