超声波碎石，主要针对于直径小于20mm的肾结石或输尿管上段结石，且多数情况下可能面临着多次超声波碎石的可能。虽然超声波碎石治疗直径较小的结石有效，但是如果多次进行碎石，难免会对肾脏或输尿管产生不良影响。超声波在释放能量时会使得肾组织细胞和输尿管受到灼伤，使得肾脏周围的血管以及输尿管出现破裂的可能，故有些患者在进行治疗时可能出现血尿的现象。其次，经常进行超声波碎石会影响到肾脏周围的血流速度使得血流速度减慢，影响肾脏应有的生理功能，严重者还有可能出现肾脏萎缩。