刚刚出生的婴儿，发现肠胃不好，很有可能是两大类原因。一种是功能性的，一种是结构性的。

功能性的原因往往是在其他的病因诱发的胃肠功能紊乱，比如说肠道的感染或者其它部位的感染，会引起新生儿宝宝的胃肠炎。另外新生儿宝宝由于胃肠功能发育的不完善，有可能会出现一些大人不会有的疾病，比如说坏死性小肠结肠炎、胃食管反流。有一些先天性的疾病也会表现为肠胃功能不好，比如说先天的乳糖酶缺乏，或者先天的对奶中的某些成分过敏都会导致肠胃功能不好。

结构的问题一般都是先天性的，比如说先天性的幽门梗阻、气道狭窄、食道气道的瘘，或者一些其他的胃肠道的先天畸形。