胚胎停育的原因非常复杂，的确一部分是因为胎儿本身的发育异常导致胚胎停育，这一部分人是可以通过检查胚胎来明确停育的原因，但是更多的人是因为母体或者是父体的因素：比如说母亲的内分泌异常，子宫发育异常，免疫功能异常，凝血机制异常场，甚至感染某些病原体如支原体、衣原体这一类的，也会导致胚胎停止发育。父亲的精子质量不高，也有可能出现。临床统计，还有一部分大约50%左右的人是不明原因的，也就是查不到任何原因的胚胎停止发育。所以一般情况下，对于第一次出现胚胎停止发育是不需要针对原因进行系统检查的，如果连续发生两次是必须认真的系统检查，明确原因，但不能只查胚胎方面的原因。